El objetivo de este trabajo fue la identificación de microorganismos presentes en la tela de grafito del biocátodo y bioánodo de una Celda de Electrólisis Microbiana (CEM), utilizando clonación y secuenciación del gen 16S del RNA ribosomal. Los resultados obtenidos indicaron que las clonas del bioánodo se relacionaron con los filos Firmicutes (15.3%), Proteobacteria (7.6%), Bacteroidetes (30.7%), and Ignavibacteriae (7.6%). Mientras que las clonas del biocátodo se relacionaron con el filo Proteobacteria (38.4\%). Las clonas del bioánodo se relacionaron con especies antes identificadas en Celdas de Electrolisis Microbianas (CEM) y Celdas de Combustible Microbiana (CCM). Sin embargo, las clonas del biocátodo se relacionaron con Rhodopseudomonas palustris, la cual no había sido reportada para la producción de hidrógeno a través de CEM. Los resultados sugieren la participación de esta especie en la producción de 0.011 m$^3$ H₂/m³ por volumen líquido de cátodo al día aplicando un voltaje de 1.